Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms