Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I0

USP17L8, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L8P0C7I0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP17L8P0C7I0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms