Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4AP0C0L4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms