Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIL1P09327 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIL1P09327 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIL1P09327 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIL1P09327 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIL1P09327 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIL1P09327 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIL1P09327 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIL1P09327 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIL1P09327 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIL1P09327 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIL1P09327 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIL1P09327 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIL1P09327 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIL1P09327 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIL1P09327 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VIL1P09327 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VIL1P09327 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIL1P09327 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIL1P09327 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIL1P09327 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIL1P09327 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIL1P09327 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIL1P09327 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VIL1P09327 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIL1P09327 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIL1P09327 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIL1P09327 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIL1P09327 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIL1P09327 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIL1P09327 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIL1P09327 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VIL1P09327 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIL1P09327 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIL1P09327 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIL1P09327 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIL1P09327 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIL1P09327 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIL1P09327 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIL1P09327 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIL1P09327 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIL1P09327 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIL1P09327 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIL1P09327 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VIL1P09327 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIL1P09327 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIL1P09327 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIL1P09327 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIL1P09327 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIL1P09327 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIL1P09327 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIL1P09327 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIL1P09327 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIL1P09327 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIL1P09327 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIL1P09327 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIL1P09327 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIL1P09327 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIL1P09327 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VIL1P09327 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIL1P09327 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIL1P09327 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIL1P09327 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIL1P09327 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIL1P09327 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIL1P09327 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIL1P09327 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIL1P09327 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIL1P09327 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIL1P09327 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VIL1P09327 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIL1P09327 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIL1P09327 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIL1P09327 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIL1P09327 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIL1P09327 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIL1P09327 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIL1P09327 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIL1P09327 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIL1P09327 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIL1P09327 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIL1P09327 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIL1P09327 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIL1P09327 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIL1P09327 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIL1P09327 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIL1P09327 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIL1P09327 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIL1P09327 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIL1P09327 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIL1P09327 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VIL1P09327 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIL1P09327 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIL1P09327 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIL1P09327 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIL1P09327 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIL1P09327 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIL1P09327 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VIL1P09327 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VIL1P09327 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms