Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHDP01880 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHDP01880 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHDP01880 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHDP01880 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHDP01880 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHDP01880 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHDP01880 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHDP01880 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHDP01880 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHDP01880 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHDP01880 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHDP01880 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHDP01880 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHDP01880 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHDP01880 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHDP01880 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHDP01880 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHDP01880 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHDP01880 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHDP01880 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHDP01880 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHDP01880 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGHDP01880 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHDP01880 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHDP01880 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGHDP01880 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGHDP01880 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGHDP01880 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGHDP01880 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IGHDP01880 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGHDP01880 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGHDP01880 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGHDP01880 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGHDP01880 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGHDP01880 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGHDP01880 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGHDP01880 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGHDP01880 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGHDP01880 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGHDP01880 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGHDP01880 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGHDP01880 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGHDP01880 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGHDP01880 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IGHDP01880 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGHDP01880 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGHDP01880 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IGHDP01880 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IGHDP01880 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IGHDP01880 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IGHDP01880 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IGHDP01880 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGHDP01880 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGHDP01880 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGHDP01880 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IGHDP01880 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms