Protein–RNA interactions for Protein: P01876

IGHA1, Immunoglobulin heavy constant alpha 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHA1P01876 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHA1P01876 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms