Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV12-3P01733 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms