Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMCP01189 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMCP01189 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMCP01189 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMCP01189 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMCP01189 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMCP01189 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMCP01189 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMCP01189 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMCP01189 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POMCP01189 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POMCP01189 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POMCP01189 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POMCP01189 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POMCP01189 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMCP01189 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMCP01189 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMCP01189 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMCP01189 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMCP01189 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMCP01189 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMCP01189 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMCP01189 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMCP01189 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMCP01189 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMCP01189 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMCP01189 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMCP01189 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POMCP01189 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMCP01189 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMCP01189 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMCP01189 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMCP01189 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMCP01189 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMCP01189 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMCP01189 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMCP01189 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMCP01189 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMCP01189 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMCP01189 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMCP01189 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMCP01189 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms