Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP1P01033 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP1P01033 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms