Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
F9P00740 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
F9P00740 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
F9P00740 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
F9P00740 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
F9P00740 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
F9P00740 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
F9P00740 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
F9P00740 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
F9P00740 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F9P00740 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F9P00740 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F9P00740 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
F9P00740 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
F9P00740 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F9P00740 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F9P00740 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F9P00740 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
F9P00740 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F9P00740 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
F9P00740 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
F9P00740 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
F9P00740 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F9P00740 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F9P00740 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F9P00740 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F9P00740 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F9P00740 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F9P00740 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
F9P00740 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F9P00740 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F9P00740 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F9P00740 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F9P00740 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F9P00740 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
F9P00740 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
F9P00740 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F9P00740 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
F9P00740 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
F9P00740 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
F9P00740 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
F9P00740 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F9P00740 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F9P00740 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F9P00740 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F9P00740 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
F9P00740 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F9P00740 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
F9P00740 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F9P00740 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F9P00740 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
F9P00740 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F9P00740 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F9P00740 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
F9P00740 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
F9P00740 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
F9P00740 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
F9P00740 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
F9P00740 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F9P00740 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms