Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD3O95983 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD3O95983 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD3O95983 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD3O95983 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD3O95983 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD3O95983 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD3O95983 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD3O95983 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD3O95983 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD3O95983 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD3O95983 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD3O95983 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD3O95983 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD3O95983 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD3O95983 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD3O95983 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD3O95983 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD3O95983 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD3O95983 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD3O95983 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD3O95983 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD3O95983 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD3O95983 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MBD3O95983 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD3O95983 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD3O95983 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD3O95983 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD3O95983 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD3O95983 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD3O95983 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD3O95983 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD3O95983 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD3O95983 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD3O95983 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD3O95983 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD3O95983 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD3O95983 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD3O95983 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD3O95983 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD3O95983 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MBD3O95983 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
MBD3O95983 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD3O95983 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD3O95983 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD3O95983 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD3O95983 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD3O95983 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD3O95983 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD3O95983 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD3O95983 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD3O95983 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD3O95983 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD3O95983 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD3O95983 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3O95983 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3O95983 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3O95983 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3O95983 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3O95983 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3O95983 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3O95983 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3O95983 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3O95983 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3O95983 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3O95983 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms