Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABARAPO95166 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms