Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAMP4O75379 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms