Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TLR5O60602 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TLR5O60602 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TLR5O60602 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TLR5O60602 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TLR5O60602 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TLR5O60602 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TLR5O60602 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TLR5O60602 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TLR5O60602 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TLR5O60602 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TLR5O60602 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TLR5O60602 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLR5O60602 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLR5O60602 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLR5O60602 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLR5O60602 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLR5O60602 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLR5O60602 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLR5O60602 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLR5O60602 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLR5O60602 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLR5O60602 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLR5O60602 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLR5O60602 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLR5O60602 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLR5O60602 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLR5O60602 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TLR5O60602 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLR5O60602 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLR5O60602 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLR5O60602 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TLR5O60602 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLR5O60602 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TLR5O60602 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLR5O60602 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLR5O60602 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLR5O60602 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLR5O60602 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TLR5O60602 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TLR5O60602 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TLR5O60602 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TLR5O60602 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TLR5O60602 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TLR5O60602 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TLR5O60602 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TLR5O60602 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TLR5O60602 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TLR5O60602 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TLR5O60602 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TLR5O60602 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TLR5O60602 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TLR5O60602 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TLR5O60602 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TLR5O60602 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TLR5O60602 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TLR5O60602 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TLR5O60602 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLR5O60602 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TLR5O60602 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLR5O60602 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLR5O60602 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLR5O60602 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLR5O60602 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TLR5O60602 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLR5O60602 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLR5O60602 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLR5O60602 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLR5O60602 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLR5O60602 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLR5O60602 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLR5O60602 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLR5O60602 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TLR5O60602 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLR5O60602 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLR5O60602 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLR5O60602 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLR5O60602 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TLR5O60602 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLR5O60602 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLR5O60602 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLR5O60602 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLR5O60602 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLR5O60602 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLR5O60602 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLR5O60602 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLR5O60602 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLR5O60602 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms