Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms