Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALUO43852 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALUO43852 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALUO43852 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALUO43852 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALUO43852 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALUO43852 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALUO43852 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALUO43852 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALUO43852 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALUO43852 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALUO43852 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CALUO43852 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALUO43852 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALUO43852 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CALUO43852 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALUO43852 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALUO43852 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALUO43852 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALUO43852 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALUO43852 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALUO43852 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALUO43852 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALUO43852 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALUO43852 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALUO43852 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALUO43852 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALUO43852 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALUO43852 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALUO43852 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALUO43852 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALUO43852 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALUO43852 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALUO43852 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALUO43852 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALUO43852 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALUO43852 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALUO43852 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALUO43852 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALUO43852 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALUO43852 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALUO43852 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALUO43852 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALUO43852 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALUO43852 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALUO43852 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALUO43852 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALUO43852 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALUO43852 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALUO43852 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALUO43852 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALUO43852 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALUO43852 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALUO43852 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALUO43852 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CALUO43852 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALUO43852 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALUO43852 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALUO43852 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALUO43852 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALUO43852 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALUO43852 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALUO43852 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CALUO43852 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALUO43852 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALUO43852 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALUO43852 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALUO43852 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALUO43852 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALUO43852 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALUO43852 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALUO43852 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALUO43852 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALUO43852 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALUO43852 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALUO43852 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALUO43852 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALUO43852 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CALUO43852 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALUO43852 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALUO43852 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms