Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms