Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF3O43395 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms