Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSI1O43347 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSI1O43347 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MSI1O43347 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSI1O43347 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSI1O43347 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSI1O43347 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MSI1O43347 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSI1O43347 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSI1O43347 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSI1O43347 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSI1O43347 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSI1O43347 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSI1O43347 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSI1O43347 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSI1O43347 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSI1O43347 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSI1O43347 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MSI1O43347 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSI1O43347 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSI1O43347 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSI1O43347 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MSI1O43347 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSI1O43347 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI1O43347 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSI1O43347 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSI1O43347 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSI1O43347 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MSI1O43347 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MSI1O43347 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSI1O43347 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSI1O43347 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSI1O43347 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSI1O43347 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSI1O43347 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSI1O43347 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI1O43347 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSI1O43347 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSI1O43347 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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