Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATMINO43313 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMINO43313 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMINO43313 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMINO43313 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMINO43313 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMINO43313 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMINO43313 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMINO43313 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMINO43313 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMINO43313 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMINO43313 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMINO43313 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMINO43313 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMINO43313 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMINO43313 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATMINO43313 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMINO43313 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMINO43313 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMINO43313 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMINO43313 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMINO43313 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMINO43313 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMINO43313 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMINO43313 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMINO43313 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMINO43313 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMINO43313 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMINO43313 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMINO43313 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATMINO43313 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATMINO43313 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMINO43313 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMINO43313 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMINO43313 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMINO43313 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMINO43313 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMINO43313 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMINO43313 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMINO43313 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMINO43313 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMINO43313 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMINO43313 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMINO43313 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMINO43313 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMINO43313 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMINO43313 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMINO43313 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMINO43313 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATMINO43313 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMINO43313 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMINO43313 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMINO43313 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMINO43313 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMINO43313 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMINO43313 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMINO43313 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMINO43313 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMINO43313 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMINO43313 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMINO43313 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMINO43313 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMINO43313 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMINO43313 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMINO43313 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMINO43313 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATMINO43313 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMINO43313 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMINO43313 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMINO43313 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMINO43313 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMINO43313 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMINO43313 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMINO43313 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMINO43313 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMINO43313 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMINO43313 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMINO43313 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMINO43313 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMINO43313 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMINO43313 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATMINO43313 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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