Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTIFO43310 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTIFO43310 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTIFO43310 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTIFO43310 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTIFO43310 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTIFO43310 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTIFO43310 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTIFO43310 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTIFO43310 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTIFO43310 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTIFO43310 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTIFO43310 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTIFO43310 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTIFO43310 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTIFO43310 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTIFO43310 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTIFO43310 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTIFO43310 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTIFO43310 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTIFO43310 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTIFO43310 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTIFO43310 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTIFO43310 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTIFO43310 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTIFO43310 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTIFO43310 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTIFO43310 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTIFO43310 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTIFO43310 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CTIFO43310 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTIFO43310 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTIFO43310 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTIFO43310 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CTIFO43310 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTIFO43310 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTIFO43310 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTIFO43310 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTIFO43310 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTIFO43310 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTIFO43310 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTIFO43310 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTIFO43310 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTIFO43310 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTIFO43310 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
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