Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSH5O43196 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSH5O43196 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSH5O43196 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSH5O43196 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSH5O43196 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSH5O43196 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSH5O43196 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSH5O43196 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSH5O43196 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSH5O43196 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MSH5O43196 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSH5O43196 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MSH5O43196 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSH5O43196 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSH5O43196 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSH5O43196 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSH5O43196 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSH5O43196 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSH5O43196 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSH5O43196 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSH5O43196 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSH5O43196 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MSH5O43196 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MSH5O43196 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MSH5O43196 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MSH5O43196 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MSH5O43196 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MSH5O43196 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MSH5O43196 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MSH5O43196 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MSH5O43196 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MSH5O43196 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MSH5O43196 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MSH5O43196 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MSH5O43196 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MSH5O43196 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MSH5O43196 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MSH5O43196 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
MSH5O43196 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
MSH5O43196 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSH5O43196 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MSH5O43196 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSH5O43196 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MSH5O43196 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSH5O43196 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MSH5O43196 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSH5O43196 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MSH5O43196 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSH5O43196 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MSH5O43196 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSH5O43196 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSH5O43196 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MSH5O43196 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MSH5O43196 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MSH5O43196 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MSH5O43196 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MSH5O43196 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MSH5O43196 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MSH5O43196 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MSH5O43196 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MSH5O43196 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MSH5O43196 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSH5O43196 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSH5O43196 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MSH5O43196 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSH5O43196 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSH5O43196 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MSH5O43196 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MSH5O43196 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MSH5O43196 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MSH5O43196 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MSH5O43196 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MSH5O43196 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSH5O43196 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MSH5O43196 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MSH5O43196 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MSH5O43196 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MSH5O43196 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MSH5O43196 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MSH5O43196 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MSH5O43196 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms