Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms