Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEFVO15553 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEFVO15553 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEFVO15553 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEFVO15553 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEFVO15553 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEFVO15553 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEFVO15553 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEFVO15553 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEFVO15553 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MEFVO15553 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEFVO15553 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEFVO15553 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEFVO15553 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEFVO15553 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEFVO15553 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEFVO15553 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEFVO15553 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEFVO15553 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEFVO15553 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEFVO15553 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEFVO15553 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEFVO15553 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEFVO15553 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEFVO15553 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEFVO15553 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEFVO15553 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MEFVO15553 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MEFVO15553 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEFVO15553 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEFVO15553 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEFVO15553 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEFVO15553 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEFVO15553 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEFVO15553 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEFVO15553 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MEFVO15553 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEFVO15553 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEFVO15553 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEFVO15553 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MEFVO15553 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEFVO15553 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEFVO15553 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEFVO15553 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEFVO15553 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEFVO15553 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MEFVO15553 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEFVO15553 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEFVO15553 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEFVO15553 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEFVO15553 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEFVO15553 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MEFVO15553 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEFVO15553 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEFVO15553 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms