Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBDO15205 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBDO15205 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBDO15205 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBDO15205 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
UBDO15205 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBDO15205 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBDO15205 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBDO15205 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBDO15205 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBDO15205 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBDO15205 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBDO15205 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBDO15205 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBDO15205 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms