Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms