Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF646O15015 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF646O15015 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF646O15015 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms