Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2A1O14983 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2A1O14983 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2A1O14983 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2A1O14983 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A1O14983 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A1O14983 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms