Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASKO14936 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASKO14936 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASKO14936 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASKO14936 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASKO14936 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASKO14936 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASKO14936 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASKO14936 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASKO14936 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASKO14936 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASKO14936 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASKO14936 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASKO14936 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASKO14936 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASKO14936 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASKO14936 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CASKO14936 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASKO14936 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASKO14936 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASKO14936 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms