Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CITO14578 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CITO14578 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CITO14578 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CITO14578 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CITO14578 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CITO14578 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITO14578 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITO14578 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITO14578 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITO14578 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITO14578 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITO14578 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITO14578 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITO14578 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITO14578 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITO14578 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITO14578 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITO14578 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITO14578 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITO14578 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITO14578 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITO14578 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITO14578 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITO14578 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITO14578 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITO14578 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITO14578 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITO14578 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITO14578 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITO14578 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITO14578 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITO14578 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITO14578 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITO14578 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITO14578 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITO14578 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITO14578 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITO14578 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITO14578 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITO14578 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CITO14578 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CITO14578 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CITO14578 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CITO14578 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CITO14578 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CITO14578 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CITO14578 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CITO14578 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CITO14578 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CITO14578 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CITO14578 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CITO14578 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CITO14578 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms