Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TULP1O00294 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TULP1O00294 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TULP1O00294 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP1O00294 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP1O00294 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP1O00294 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP1O00294 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP1O00294 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP1O00294 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP1O00294 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP1O00294 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP1O00294 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TULP1O00294 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP1O00294 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP1O00294 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP1O00294 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP1O00294 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP1O00294 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP1O00294 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP1O00294 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP1O00294 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP1O00294 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP1O00294 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TULP1O00294 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP1O00294 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP1O00294 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP1O00294 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP1O00294 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP1O00294 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP1O00294 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP1O00294 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP1O00294 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP1O00294 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP1O00294 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP1O00294 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP1O00294 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP1O00294 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP1O00294 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP1O00294 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP1O00294 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TULP1O00294 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP1O00294 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP1O00294 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP1O00294 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP1O00294 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP1O00294 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP1O00294 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP1O00294 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP1O00294 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP1O00294 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP1O00294 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP1O00294 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP1O00294 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP1O00294 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP1O00294 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TULP1O00294 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TULP1O00294 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms