Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIEO00221 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms