Protein–RNA interactions for Protein: H3BRJ5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRJ5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BRJ5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BRJ5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BRJ5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BRJ5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BRJ5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BRJ5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BRJ5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BRJ5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BRJ5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BRJ5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BRJ5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BRJ5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BRJ5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BRJ5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BRJ5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BRJ5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BRJ5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BRJ5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BRJ5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BRJ5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BRJ5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BRJ5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BRJ5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BRJ5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BRJ5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BRJ5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BRJ5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BRJ5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BRJ5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BRJ5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BRJ5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BRJ5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BRJ5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BRJ5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BRJ5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BRJ5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BRJ5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BRJ5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BRJ5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BRJ5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BRJ5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H3BRJ5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H3BRJ5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
H3BRJ5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
H3BRJ5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
H3BRJ5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H3BRJ5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BRJ5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H3BRJ5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BRJ5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
H3BRJ5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BRJ5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BRJ5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BRJ5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BRJ5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BRJ5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H3BRJ5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.31■■□□□ 1
H3BRJ5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BRJ5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms