Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
E9PCH4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
E9PCH4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
E9PCH4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
E9PCH4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
E9PCH4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
E9PCH4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
E9PCH4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
E9PCH4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
E9PCH4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
E9PCH4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
E9PCH4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
E9PCH4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
E9PCH4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
E9PCH4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
E9PCH4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
E9PCH4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
E9PCH4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
E9PCH4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
E9PCH4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
E9PCH4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
E9PCH4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
E9PCH4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
E9PCH4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
E9PCH4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
E9PCH4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
E9PCH4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
E9PCH4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
E9PCH4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
E9PCH4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
E9PCH4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
E9PCH4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
E9PCH4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
E9PCH4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
E9PCH4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
E9PCH4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
E9PCH4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
E9PCH4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
E9PCH4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
E9PCH4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
E9PCH4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
E9PCH4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
E9PCH4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
E9PCH4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
E9PCH4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
E9PCH4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
E9PCH4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
E9PCH4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
E9PCH4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
E9PCH4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
E9PCH4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
E9PCH4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
E9PCH4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
E9PCH4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
E9PCH4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
E9PCH4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
E9PCH4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
E9PCH4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
E9PCH4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
E9PCH4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
E9PCH4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
E9PCH4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
E9PCH4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
E9PCH4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
E9PCH4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
E9PCH4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
E9PCH4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
E9PCH4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
E9PCH4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
E9PCH4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
E9PCH4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
E9PCH4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
E9PCH4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
E9PCH4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
E9PCH4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
E9PCH4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
E9PCH4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
E9PCH4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
E9PCH4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
E9PCH4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
E9PCH4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms