Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHLA1C9JL84 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms