Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HACD1B0YJ81 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HACD1B0YJ81 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms