Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOTOA8MTQ0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms