Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MEIS3P2A8K0S8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms