Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RTL1A6NKG5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms