Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms