Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms