Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F8A0AVK6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F8A0AVK6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms