Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
A0A0U1RQJ8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQJ8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQJ8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQJ8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQJ8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQJ8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQJ8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQJ8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms