Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAMTA1Q9Y6Y1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAMTA1Q9Y6Y1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms