Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CD2APQ9Y5K6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD2APQ9Y5K6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms