Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB11Q9Y547 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB11Q9Y547 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms