Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP15Q9Y4E8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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