Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZDHHC9Q9Y397 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC9Q9Y397 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms