Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms