Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHKBQ9Y259 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHKBQ9Y259 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHKBQ9Y259 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHKBQ9Y259 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHKBQ9Y259 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHKBQ9Y259 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHKBQ9Y259 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHKBQ9Y259 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms